Vakfın İstanbul’daki kuruluşu, Merkezi Amerika Birleşik Devletleri’nde bulunan Dodge Clark Fondation Vakfı’na dayanır. Amerika’daki Ana Vakıf YWCA önderliğinde Amerikalı ve Türk gönüllülerden oluşan bir komite kurarak İstanbul’da çalışmalarına 1911 yılında başladı.
Yapı Merkezi, 1965 yılında “insanlara mutluluk ortamı yaratarak hizmet edecek çağdaş yapı projelerini üretmek ve inşaatlarını gerçekleştirmek” amacıyla kurulmuştur.